די ריסערטשערז געניצט די נייַ הויך-טראַפּוט סטאַביל יסאָטאָפּע פּראָובינג (HT-SIP) רערנ - ליניע און מעטאַגענאָמיקס צו באַקומען דער ערשטער קוק אין די אַקטיוו מיקראָביאָמע אַרומיק אַ וווילטויק פאַבריק סימביאַנט, אַרבוסקולאַר מיקאָררהיזאַל פונגי (אַמף). קרעדיט: Lawrence Livermore National Laboratory
פֿאַרבינדונג די אידענטיטעט פון ווילד מייקראָובז מיט זייער פיזיאַלאַדזשיקאַל טרייץ און ינווייראַנמענאַל פאַנגקשאַנז איז אַ שליסל ציל פֿאַר ינווייראַנמענאַל מיקראָביאָלאָגיסץ. פון די טעקניקס וואָס שטרעבן פֿאַר דעם ציל, סטאַביל יסאָטאָפּע פּראָבינג - SIP - איז געהאלטן די מערסט עפעקטיוו פֿאַר לערנען אַקטיוו מייקראָואָרגאַניזאַמז אין נאַטירלעך סעטטינגס.
לאָראַנס ליווערמאָרע נאַשאַנאַל לאַבאָראַטאָריע (LLNL) סייאַנטיס האָבן דעוועלאָפּעד אַ נייַע טעכניק - הויך-טרופּוט SIP - וואָס אָטאַמייץ עטלעכע סטעפּס אין דעם פּראָצעס פון סטאַביל יסאָטאָפּע פּראָובינג, אַלאַוינג ינוועסטאַגיישאַנז פון מייקראָוביאַל טעטיקייט פון מייקראָואָרגאַניזאַמז אונטער רעאַליסטיש טנאָים, אָן די נויט פֿאַר לאַב קאַלטשערינג.
אין SIP, אַקטיוו מייקראָובז זענען יידענאַפייד דורך ינקאָרפּעריישאַן פון סטאַביל יסאָטאָפּעס אין זייער בייאַמאַס. עס איז צווישן די מערסט שטאַרק מעטהאָדס אין מייקראָוביאַל יקאַלאַדזשי זינט עס קענען ידענטיפיצירן אַקטיוו מייקראָובז און זייער פיזיאַלאַדזשיקאַל טרייץ (נוץ פון סאַבסטרייט, סעליאַלער בייאָוקעמאַסטרי, מאַטאַבאַליזאַם, וווּקס, מאָרטאַליטי) אין קאָמפּלעקס קהילות אונטער געבוירן טנאָים.
טיפּיקאַללי, די SIP אופֿן ריקווייערז היפּש האַנט-אויף אַרבעט און בלויז אַלאַוז פֿאַר אַ קליין נומער פון סאַמפּאַלז. אָבער די נייַע LLNL טעכניק ריקווייערז איין-זעקסט די סומע פון האַנד-אויף אַרבעט קאַמפּערד מיט די מאַנואַל זופּן און אַלאַוז 16 סאַמפּאַלז צו זיין פּראַסעסט סיימאַלטייניאַסלי.
"אונדזער האַלב-אָטאַמייטיד צוגאַנג דיקריסאַז אָפּעראַטאָר צייט און ימפּרוווז רעפּראָדוסיביליטי דורך טאַרגאַטינג די מערסט אַרבעט-אינטענסיווע סטעפּס פון זופּן," האט געזאגט LLNL געלערנטער ערין נוקסיאָ, און הויפּט מחבר פון אַ פּאַפּיר אין דער זשורנאַל מיקראָביאָמע. "מיר האָבן איצט געוויינט דעם צוגאַנג צו פּראָצעס איבער אַ טויזנט סאַמפּאַלז, אַרייַנגערעכנט עטלעכע פֿון זייער אַנדערסטודיד באָדן מיקראָכאַבאַטאַץ."
איינער אַזאַ מיקראָכאַבאַט איז דער באָדן גלייך אַרומיק די געוועבן פון מיקאָררהיזאַע - אַ טיפּ פון פונגי וואָס פארמען סימביאָטיש באַציונגען מיט 72% פון אַלע לאַנד געוויקסן. אין וועקסל פֿאַר פאַבריק טשאַד, די פונגוס (אַרבוסקולאַר מיקאָררהיזאַל פונגי) סאַפּלייז זיין מחנות מיט יקערדיק רעסורסן אַזאַ ווי ניטראָגען, פאַספעראַס און וואַסער.
אין דעם דערווייַז-פון באַגריף לערנען, די מחברים געוויזן די "עסנוואַרג וועב" פון ינטעראַקשאַנז סטימיאַלייטאַד דורך מיקאָררהיזאַל פאַנדזשיי אין באָדן.
"מיר טראַכטן דאָס איז אַ הויפּט מאַרשרוט פֿאַר ווי פאַבריק טשאַד ווערט ברייט פונאנדערגעטיילט אין באָדן. באָדן האלט די גרעסטע בעקן פון אַקטיוולי סייקלינג אָרגאַניק טשאַד אויף דעם פּלאַנעט, "האט געזאגט די קאָ-קאָראַספּאַנדינג מחבר Jennifer Pett-Ridge, וואָס איז די LLNL פּרויעקט פירן און הויפּט פון די דעפּאַרטמענט פון ענערגיע ס אָפפיסע פון וויסנשאַפֿט "מייקראָובז פּערסיסט" באָדן מיקראָביאָמע וויסנשאפטלעכע פאָקוס שטח. . "מיר סיקוואַנס אַ קליינטשיק סומע פון דנאַ, באשלאסן די אַקטיוו אָרגאַניזאַמז און דערנאָך ריקאַנסטראַקטיד זייער גענאָמעס און פּאָטענציעל ינטעראַקשאַנז."
אנדערע LLNL מחברים אַרייַננעמען Steven Blazewicz, Marissa Lafler, Ashley Campbell, Jeffrey Kimbrel, Jessica Wollard, Rachel Hestrin און פאָרשער פון Lawrence Berkeley National Laboratory, DOE Joint Genome Institute און University of California, Berkeley.